अफगानों द्वारा राठौर्स को अपनी मूल देश की कौनाज से निकाल दिया गया था। वे वर्तमान में जोधपुर के पास, पाली से भाग गए राठौर सियाहा ने एक स्थानीय राजकुमार की बहन से शादी की इससे राठौर्स को इस क्षेत्र में खुद को स्थापित और मजबूत करने में मदद मिली। कुछ समय में उन्होंने मंदौर के प्रतिहारों को केवल 9 किमी जोधपुर में छोड़ दिया। प्रारंभ में, मंदोर ने अपनी राजधानी के रूप में सेवा की, लेकिन 1459 तक, राठौर्स ने एक सुरक्षित पूंजी की आवश्यकता महसूस की। इससे जोधपुर, सन सिटी, राव जोधा द्वारा बनाया गया है।
राठौर्स ने औरंगजेब को छोड़कर सभी मुगलों के साथ अच्छे संबंध का अनुभव किया उत्तराधिकार के लिए उनके संघर्ष में महाराजा जसवंत सिंह ने भी शाहजहां को समर्थन दिया। औरंगजेब की मृत्यु के बाद, महाराजा अजित सिंह ने अजमेर से मुगलों को बाहर कर दिया और इसे मारवाड़ (अब जोधपुर) में जोड़ा। महाराजा उदय सिंह के शासनकाल में, जोधपुर एक आधुनिक आधुनिक शहर बन गया।
